Real-Time PCR Kitleri
İdrar Yolu Enfeksiyonu Patojenleri Paneli
İdrar yolu enfeksiyonları (İYE), üriner sistemin farklı bölümlerini etkileyen ve özellikle uygun şekilde tedavi edilmediğinde ciddi komplikasyonlara yol açabilen yaygın enfeksiyonlardır. Benzer klinik bulgulara neden olabilen farklı etkenlerin varlığı, doğru patojenin hızlı ve güvenilir şekilde tanımlanmasını kritik hale getirir. Bosphore İdrar Yolu Enfeksiyonu Patojenleri Panel Kitleri, insan idrar örneklerinde üriner sistem enfeksiyonlarıyla ilişkili yaygın görülen bakteri ve mantar patojenlerinin Real-Time PCR teknolojisi ile eş zamanlı tespitini sağlar. Seçili kitler, klinik açıdan önemli antibiyotik direnç genlerinin aynı analiz içerisinde saptanmasına da olanak tanıyarak tanı sürecini destekler ve uygun tedavi kararlarının alınmasına katkı sağlar.
Başlıca Özellikler
İş Akışı
Teknik Özellikler
Bu tabloda belirtilen kanallar ve örnek tipleri kitlere (singleplex/multiplex) göre değişiklik gösterebilir. İlişkili kitlerin ayrıntılı bilgilerini aşağıda inceleyebilirsiniz.
| Termal Protokol | Tüm parametreler için tek termal protokol |
| Örnek Tipleri | İnsan idrar örneği |
| Raf Ömrü | 18 Ay |
| Kanallar | FAM, HEX, Texas Red, Cy5 |
| Nakliye / Depolama | (-90°C)-(-20°C) / -20°C |
İdrar Yolu Enfeksiyonları Panel Kitleri
Bosphore UTI Panel Kiti v1, insan idrar örneklerinden Enterococcus faecalis, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, Candida auris, Enterococcus faecium, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus spp., Serratia marcescens, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Candida krusei, Morganella morganii, Candida albicans, Candida glabrata, Staphylococcus epidermidis, Enterobacter cloacae, Actinobaculum schaalii, Candida tropicalis, Streptococcus spp., Escherichia coli, Citrobacter freundii, Citrobacter koseri, Candida parapsilosis, Enterobacter (Klebsiella) aerogenes, Klebsiella oxytoca, Proteus mirabilis, Mycoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum, Gardnerella vaginalis ve Streptococcus pyogenes patojenlerini saptamak ve karakterize etmek üzere tasarlanmış bir Real-Time PCR kitidir. Ayrıca Metisilin direnç geni (MecA), New Delhi Metallo-beta-laktamaz (NDM), Oksasilinaz-48-benzeri (OXA-48), K. pneumoniae karbapenemazı (KPC), İmipenemaz (IMP), Verona Integron-Kodlu Metallo-beta-laktamaz (VIM), Sefotaksimaz (CTX-M), Mobilize kolistin direnci-1 (MCR-1), Vankomisin direnç A (VanA), Vankomisin direnç B (VanB), Oksasilinaz-23-benzeri (OXA-23), Oksasilinaz-1-benzeri (OXA-1), kinolon direnç geni (QnrA), trimetoprim dirençli dihidrofolat redüktaz 1 (dfrA1) ve trimetoprim dirençli dihidrofolat redüktaz 5 (dfrA5) direnç genlerinin tespitini sağlar.
Floresans tespiti FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| Bileşen | FAM
(Gen) |
HEX
(Gen) |
Texas RED
(Gen) |
Cy5
(Gen) |
| PCR Master Mix 1 | K. pneumoniae (Hemolysin geni) |
S. aureus (nucA geni) |
C. auris (ITS1/5.8S rRNA/ITS2/ LSU rRNA geni) |
E. faecalis (DDL geni) |
| PCR Master Mix 2 | S. agalactiae (cfB geni) |
Staphylococcus spp. (tuf geni) |
S. marcescens (16S rRNA/ITS/23S rRNA) |
E. faecium (DDL geni) |
| PCR Master Mix 3 | A. baumannii (T6SS geni) |
M. morganii (23sRNA geni) |
C. krusei (ITS2 bölgesi) |
P. aeruginosa (ecfX geni) |
| PCR Master Mix 4 | C. albicans (ITS2 bölgesi) |
S. epidermidis (sodA geni) |
E. cloacae (rpoB geni) |
C. glabrata (ITS2 bölgesi) |
| PCR Master Mix 5 | A. schaalii (gyrB geni) |
C. tropicalis (ITS2 bölgesi) |
E. coli (uidA geni) |
Streptococcus spp. (16S rRNA/ ITS/23S rRNA geni) |
| PCR Master Mix 6 | Mec A | – | C. parapsilosis (ITS2 bölgesi) |
C. koseri (lac Z geni) |
| PCR Master Mix 7 | K. oxytoca (pehX geni) |
P. mirabilis (ureR geni) |
E. (klebsiella) aerogenes (gyrB geni) |
– |
| PCR Master Mix 8 | U. urealyticum (UreB geni) |
– | M. hominis (gap geni) |
G. vaginalis (16sRNA geni) |
| PCR Master Mix 9 | NDM | OXA 48 | S. pyogenes (speB geni) |
KPC |
| PCR Master Mix 10 | IMP | VIM | CTX-M | MCR-1 |
| PCR Master Mix 11 | Van A | Van B | C. freundii (cyclic di-GMP phosphodiesterase) |
İnternal Kontrol |
| PCR Master Mix 12 | OXA 23 | OXA 1 | QnrA | dfrA 1/ dfrA 5 |
Kit içerisinde DNA izolasyonunu, PCR inhibisyonunu veya uygulama hatalarını kontrol etmek amacıyla bir internal kontrol entegre edilmiştir. Internal kontrole ait amplifikasyon verileri, yalnızca PCR Master Mix 11’deki Cy5 filtresi ile tespit edilir. Internal kontrol, DNA izolasyonu aşamasında veya PCR adımında eklenebilir.
Bosphore UTI Panel Kiti v2, insan idrar örneklerinden belirtilen patojenlere ait spesifik gen bölgelerini saptamak ve karakterize etmek üzere tasarlanmış bir Real-Time PCR kitidir.
Floresans tespiti FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| Bileşen | FAM
(Gen) |
HEX
(Gen) |
Texas RED
(Gen) |
Cy5
(Gen) |
| PCR Master Mix 1 | K. pneumoniae (Hemolysin geni) |
S. aureus (nucA geni) |
C. auris (ITS1/5.8S rRNA/ITS2/ LSU rRNA geni) |
E. faecalis (DDL geni) |
| PCR Master Mix 2 | S. agalactiae (cfB geni) |
Staphylococcus spp. (tuf geni) |
S. marcescens (16S rRNA/ITS/23S rRNA) |
E. faecium (DDL geni) |
| PCR Master Mix 3 | A. baumannii (T6SS geni) |
M. morganii (23sRNA geni) |
C. krusei (ITS2 region) |
P. aeruginosa (ecfX geni) |
| PCR Master Mix 4 | C. albicans (ITS2 bölgesi) |
S. epidermidis (sodA geni) |
E. cloacae (rpoB geni) |
C. glabrata (ITS2 bölgesi) |
| PCR Master Mix 5 | – | C. tropicalis (ITS2 bölgesi) |
E. coli (uidA geni) |
Streptococcus spp. (16S rRNA/ITS/23S rRNA geni) |
| PCR Master Mix 6 | Mec A | – | C. parapsilosis (ITS2 bölgesi) |
C. koseri (lac Z geni) |
| PCR Master Mix 7 | K. oxytoca (pehX geni) |
P. mirabilis (ureR geni) |
E. (klebsiella) aerogenes (gyrB geni) |
– |
| PCR Master Mix 8 | U. urealyticum (UreB geni) |
– | M. hominis (gap geni) |
G. vaginalis (16sRNA geni) |
| PCR Master Mix 9 | NDM | OXA 48 | S. pyogenes (speB gene) |
KPC |
| PCR Master Mix 10 | IMP | VIM | CTX-M | MCR-1 |
| PCR Master Mix 11 | Van A | Van B | C. freundii (cyclic di-GMP phosphodiesterase) |
Internal Control |
| PCR Master Mix 12 | OXA 23 | OXA 1 | QnrA | dfrA 1/ dfrA 5 |
| PCR Master Mix 13 | A. schaalii (gyrB gene) |
– | – | – |
DNA izolasyonu, PCR inhibisyonu veya uygulama kaynaklı sorunları kontrol etmek amacıyla kite bir internal kontrol entegre edilmiştir. Internal kontrolün amplifikasyon verileri, yalnızca PCR Master Mix 11 için Cy5 filtresi ile tespit edilir. Internal kontrol, DNA izolasyonu sırasında veya PCR aşamasında eklenebilir.
Bosphore UTI 3 Panel Kiti, insan idrar örneklerinden Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Candida auris, Enterococcus faecalis, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus spp., Serratia marcescens, Enterococcus faecium, Acinetobacter baumannii, Morganella morganii, Candida krusei, Pseudomonas aeruginosa, Candida albicans, Staphylococcus epidermidis, Enterobacter cloacae, Candida glabrata, Actinobaculum schaalii, Candida tropicalis, Escherichia coli, Streptococcus spp., Candida parapsilosis, Citrobacter koseri, Klebsiella oxytoca, Proteus mirabilis, Enterobacter (Klebsiella) aerogenes, Ureaplasma urealyticum, Providencia stuartii, Mycoplasma hominis, Gardnerella vaginalis, Proteus vulgaris, Pantoea agglomerans ve Citrobacter freundii patojenlerini saptamak ve karakterize etmek üzere tasarlanmış bir Real-Time PCR kitidir.
Floresans tespiti FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| Bileşen | FAM
(Gen) |
HEX
(Gen) |
Texas RED
(Gen) |
Cy5
(Gen) |
| PCR Master Mix 1 | K. pneumoniae
(Hemolysin geni) |
S. aureus
(nucA geni) |
C. auris
(ITS1/5.8S rRNA/ITS2/ LSU rRNA geni) |
E. faecalis
(DDL geni) |
| PCR Master Mix 2 | S. agalactiae
(cfB geni) |
Staphylococcus spp.
(tuf geni) |
S. marcescens
(16S rRNA/ITS/23S rRNA geni) |
E. faecium
(DDL geni) |
| PCR Master Mix 3 | A. baumannii (T6SS geni) | M. morganii
(23sRNA geni) |
C. krusei
(ITS2 bölgesi) |
P. aeruginosa
(ecfX geni) |
| PCR Master Mix 4 | C. albicans
(ITS2 bölgesi) |
S. epidermidis
(sodA geni) |
E. cloacae
(rpoB geni) |
C. glabrata
(ITS2 bölgesi) |
| PCR Master Mix 5 | A. schaalii
(gyrB geni) |
C. tropicalis
(ITS2 bölgesi) |
E. coli
(uidA geni) |
Streptococcus spp.
(16S rRNA/ ITS/23S rRNA geni) |
| PCR Master Mix 6 | – | – | C. parapsilosis
(ITS2 bölgesi) |
C. koseri
(lac Z geni) |
| PCR Master Mix 7 | K. oxytoca
(pehX geni) |
P. mirabilis
(ureR geni) |
E. (klebsiella) aerogenes
(gyrB geni) |
– |
| PCR Master Mix 8 | U. urealyticum
(UreB geni) |
P. stuartii
(ompA) |
M. hominis
(gap geni) |
G. vaginalis
(16sRNA geni) |
| PCR Master Mix 9 | P. vulgaris
(AbgT) |
P. agglomerans
(PagR) |
C. freundii
(cyclic di-GMP phosphodiesterase) |
İnternal Kontrol |
Kit içerisinde DNA izolasyonunu, PCR inhibisyonunu veya uygulama hatalarını kontrol etmek amacıyla bir internal kontrol entegre edilmiştir. Internal kontrole ait amplifikasyon verileri, yalnızca PCR Master Mix 9’un Cy5 filtresi ile tespit edilir. Internal kontrol, DNA izolasyonu aşamasında veya PCR adımında eklenebilir.
Bosphore UTI Panel Kiti v4, idrar örneklerinden Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Candida auris, Enterococcus faecalis, Streptococcus agalactiae, Serratia marcescens, Enterococcus faecium, Acinetobacter baumannii, Morganella morganii, Candida krusei, Pseudomonas aeruginosa, Candida albicans, Staphylococcus saprophyticus, Enterobacter cloacae, Candida glabrata, Aerococcus urinae, Candida tropicalis, Escherichia coli, Corynebacterium urealyticum, Proteus vulgaris, Providencia stuarti, Candida parapsilosis, Klebsiella oxytoca, Proteus mirabilis, Enterobacter (Klebsiella) aerogenes, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Citrobacter freundii ve Treponema pallidum’u saptayan ve ayırt eden, vücut dışı tanıya yönelik bir Real-Time PCR kitidir.
Floresans saptama FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| Bileşen | FAM (Gen) |
HEX (Gen) |
Texas RED (Gen) |
Cy5 (Gen) |
| PCR Master Mix 1 | K. pneumoniae
(Hemolysin geni) |
S. aureus
(nucA geni) |
C. auris
(ITS1/5.8S rRNA/ITS2/ LSU rRNA geni) |
E. faecalis
(DDL geni) |
| PCR Master Mix 2 | S. agalactiae
(cfB geni) |
– | S. marcescens
(16S rRNA/ITS/23S rRNA) |
E. faecium
(DDL geni) |
| PCR Master Mix 3 | A. baumannii (T6SS geni) | M. morganii
(23sRNA geni) |
C. krusei
(ITS2 bölgesi) |
P. aeruginosa
(ecfX geni) |
| PCR Master Mix 4 | C. albicans
(ITS2 bölgesi) |
S. saphrophyticus
(sodA geni) |
E. cloacae
(rpoB geni) |
C. glabrata
(ITS2 bölgesi) |
| PCR Master Mix 5 | A. urinae
(tuf geni) |
C. tropicalis
(ITS2 bölgesi) |
E. coli
(uidA geni) |
C.urealyticum
(ureC geni) |
| PCR Master Mix 6 | P. vulgaris
(AbgT) |
P. stuartii
(ompA) |
C. parapsilosis
(ITS2 bölgesi) |
İnternal Kontrol |
| PCR Master Mix 7 | K. oxytoca
(pehX geni) |
P. mirabilis
(ureR geni) |
E. (klebsiella) aerogenes
(gyrB geni) |
– |
| PCR Master Mix 8 | U. urealyticum (Urease complex) |
U. parvum (ureC) |
C. freundii
(cyclic di-GMP phosphodiesterase) |
Treponema pallidum
(polA) |
Kit, DNA izolasyonu, PCR inhibisyonu ve uygulama hatalarını kontrol etmek için internal kontrol (IC) barındırmaktadır. İnternal kontrol, DNA izolasyonu sırasında ya da PCR reaksiyon karışımına eklenebilir. İnternal kontrol için floresans saptama PCR Master Mix 6’nın Cy5 filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
Bosphore UTI Panel Kiti v5, insan idrar örneklerinden Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Enterococcus faecalis, Streptococcus agalactiae, Staphylococcus spp., Serratia marcescens, Enterococcus faecium, Acinetobacter baumannii, Morganella morganii, Candida parapsilosis, Pseudomonas aeruginosa, Candida albicans, Staphylococcus epidermidis, Enterobacter cloacae, Candida glabrata, Klebsiella oxytoca, Proteus mirabilis, Enterobacter (Klebsiella) aerogenes, Citrobacter koseri, Ureaplasma urealyticum, Providencia stuartii, Mycoplasma hominis, Gardnerella vaginalis, Proteus vulgaris, Pantoea agglomerans, Citrobacter freundii, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium ve Ureaplasma parvum patojenlerini saptamak ve karakterize etmek üzere tasarlanmış bir Real-Time PCR kitidir.
| Bileşen | FAM
(Gen) |
HEX
(Gen) |
Texas RED
(Gen) |
Cy5
(Gen) |
| PCR Master Mix 1 | K. pneumoniae
(Hemolysin geni) |
S. aureus
(nucA geni) |
E. coli
(uidA geni) |
E. faecalis
(DDL geni) |
| PCR Master Mix 2 | S. agalactiae
(cfB geni) |
Staphylococcus spp.
(tuf geni) |
S. marcescens
(16S rRNA/ITS/23S rRNA geni) |
E. faecium
(DDL geni) |
| PCR Master Mix 3 | A. baumannii (T6SS geni) | M. morganii
(23sRNA geni) |
C. parapsilosis
(ITS2 bölgesi) |
P. aeruginosa
(ecfX geni) |
| PCR Master Mix 4 | C. albicans
(ITS2 bölgesi) |
S. epidermidis
(sodA geni) |
E. cloacae
(rpoB geni) |
C. glabrata
(ITS2 bölgesi) |
| PCR Master Mix 5 | K. oxytoca
(pehX geni) |
P. mirabilis
(ureR geni) |
E. (klebsiella) aerogenes
(gyrB geni) |
C. koseri
(lac Z geni) |
| PCR Master Mix 6 | U. urealyticum
(Urease complex) |
P. stuartii
(ompA) |
M. hominis
(GAPDH) |
G. vaginalis
(16sRNA geni) |
| PCR Master Mix 7 | P. vulgaris
(AbgT) |
P. agglomerans
(PagR) |
C. freundii
(cyclic di-GMP phosphodiesterase) |
İnternal Kontrol |
| PCR Master Mix 8 | C. trachomatis
(OmpA) |
N. gonorrhoeae
(Porin) |
M. genitalium
(mgpC) |
U. parvum
(ureC) |
Kit içerisinde DNA izolasyonunu, PCR inhibisyonunu veya uygulama hatalarını kontrol etmek amacıyla bir internal kontrol entegre edilmiştir. Internal kontrole ait amplifikasyon verileri, yalnızca PCR Master Mix 7’nin Cy5 filtresi ile tespit edilir. Internal kontrol, DNA izolasyonu aşamasında veya PCR adımında eklenebilir.
Bosphore UTI-ABR Mini Panel Kiti, idrar örneklerinden New Delhi Metallo-beta-laktamaz (NDM), Oksasilinaz-48-benzeri (OXA-48), K. pneumoniae karbapenemazı (KPC), İmipenemaz (IMP), Verona Integron-Kodlu Metallo-beta-laktamaz (VIM), Sefotaksimaz (CTX-M), Mobilize kolistin direnci-1 (MCR-1), Oksasilin hidrolize eden beta-laktamaz 23 (OXA-23), Oksasilin hidrolize eden beta-laktamaz 1 (OXA-1), Kinolon direnç proteini A (QnrA) ve dihidrofolat redüktaz A1 / dihidrofolat redüktaz A5 (dfrA1 / dfrA5) direnç genlerini saptamak ve karakterize etmek üzere tasarlanmış bir Real-Time PCR kitidir.
Floresans tespiti FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| Bileşen | FAM
(Gen) |
HEX
(Gen) |
Texas RED
(Gen) |
Cy5
(Gen) |
| PCR Master Mix 1 | NDM | OXA 48 | – | KPC |
| PCR Master Mix 2 | IMP | VIM | CTX-M | MCR-1 |
| PCR Master Mix 3 | OXA 23 | OXA 1 | QnrA | dfrA 1/ dfrA 5 |
Bosphore UTI AMR Panel Kiti v1, New Delhi Metallo-beta-lactamase (NDM), Imipenemase (IMP), Oxacillinase-48-like (OXA-48), Oxacillinase-1-like (OXA-1), Methicillin resistance geni (mecA), K. pneumoniae carbapenemase (KPC), Oxacillinase-23-like (OXA-23), Verona Integron-Encoded Metallo-beta-lactamase (VIM), Erythromycin ribosomal methylase A, B ve C geni (ermA, ermB, ermC), Cefotaximase – Munich Group 1 (CTX-M Group 1), Temoniera-beta-lactamase (TEM), Guiana Extended Spectrum beta-lactamase (GES), Cefotaximase – Munich Group 2 (CTX-M Group 2), Pseudomonas Extended Resistance (PER), Cephamycinase-1 (CMY-1), Cephamycinase-2 (CMY-2), Dhahran beta-lactamase (DHA), MIR beta-lactamase (MIR), AmpC-type beta-lactamases (blaACC, blaACT, FOX, MOX), Sulfhydryl variable (SHV), Vietnamese Extended-spectrum Beta-lactamase (VEB), quinolone-direnç geni (qnrA, qnrB ve qnrS), tetracycline direnç geni (tet (M)), trimethoprim direnç dihydrofolate reductase 5 (dfrA5), trimethoprim-resistant dihydrofolate reductase 1 (dfrA1), Vancomycin direnç A (vanA), Vancomycin direnç C (vanC), Vancomycin direnç B (vanB) ve sulfonamide direnç geni (Sul2) genlerini insan idrar örneklerinde saptayan ve ayırt eden, vücut dışı tanıya yönelik bir Real-Time PCR kitidir.
Floresans saptama FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| Bileşen | FAM (Gen) |
HEX (Gen) |
Texas RED (Gen) |
Cy5 (Gen) |
| PCR Master Mix 1 | NDM, IMP | OXA-48, OXA-1 | mecA | KPC |
| PCR Master Mix 2 | OXA-23 | VIM | ermA, ermB | ermC |
| PCR Master Mix 3 | CTX-M Group I | TEM, GES | CTX-M Group II | PER |
| PCR Master Mix 4 | CMY-1, CMY-2 | DHA, MIR | blaACC, blaACT | FOX, MOX |
| PCR Master Mix 5 | SHV, VEB | qnrA, qnrB, qnrS | tet (M) | dfrA5/A1 |
| PCR Master Mix 6 | vanA, vanC | vanB | Sul2 | İnternal Kontrol |
Kit, DNA izolasyonu, PCR inhibisyonu ve uygulama hatalarını kontrol etmek için internal kontrol (IC) barındırmaktadır. İnternal kontrol, DNA izolasyonu aşamasında veya PCR adımında eklenebilir. İnternal kontrol için floresans saptama PCR Master Mix 6’nın Cy5 filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
