Real-Time PCR Kitleri
SARS-CoV-2 Paneli
SARS-CoV-2, veya Şiddetli Akut Solunum Yolu Sendromu Koronavirüsü 2, koronavirüs ailesinin bir üyesidir. COVID-19 pandemisine neden olan solunum yolu hastalığı COVID-19’un etkenidir. Virüs daha önce 2019 yeni koronavirüs (2019-nCoV) ve insan koronavirüsü 2019 (HCoV-19 veya hCoV-19) olarak adlandırılmıştır.
SARS-CoV-2, insanlarda oldukça bulaşıcı olan tek sarmallı bir RNA virüsüdür. Enfeksiyon belirtileri ateş, öksürük ve nefes darlığını içerebilir ve hafif semptomlardan ciddi hastalıklara ve bazı durumlarda ölüme kadar değişiklik gösterebilir. SARS-CoV-2, enfekte bir kişinin konuşması, öksürmesi, hapşırması veya nefes alması sırasında oluşan solunum damlacıkları ve aerosoller yoluyla yayılır.
Solunum yolu enfeksiyonlarının (RTI) semptomlarının birbirleri ile örtüşebilmesinden dolayı, doğru patojeni tespit etmek ve hemen tedaviye başlamak hayati önem taşır. Bosphore SARS-CoV-2 Panel Kitleri, diğer solunum yolu patojenlerini SARS-CoV-2’den ayırt ederek solunum yolu enfeksiyonlarının erken ve doğru tespitini sağlar.
Başlıca Özellikler
İş Akışı
Teknik Özellikler
| Termal Protokol | Tüm parametreler için tek termal protokol |
| Örnek Tipleri | Nazofaringeal, orofaringeal sürüntüler, balgam ve tükürük dahil olmak üzere insan solunum örnekleri |
| Raf Ömrü | 18 Ay |
| Kanallar | FAM, HEX, Texas Red, Cy5, Quasar 705, ROX |
| Nakliye / Depolama | (-90°C)-(-20°C) / -20°C |
SARS-CoV-2 Panel Kitleri
Bosphore SARS-CoV-2/Solunum Patojenleri Panel Kiti v1, nazofarengeal, orofarengeal swablar ve tükürük dahil olmak üzere insan solunum örneklerinden SARS-CoV-2, RSV A/B, İnfluenza A/B, Enterovirüs, İnsan Metapnömovirüs A/B, Adenovirüs, İnsan Parainfluenza virüsleri 1/2/3/4, Rhinovirüs, Mycoplasma pneumoniae ve Legionella pneumophila patojenlerini tespit ve karakterize eden in vitro diagnostik için bir Real-Time PCR kitidir. Floresan tespiti FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| FAM | HEX | Texas RED | Cy5 | |
| PCR Master Mix 1 | SARS-CoV-2 | RSV A/B | İnternal Kontrol | İnfluenza A/B |
| PCR Master Mix 2 | Enterovirüs | İnsan Metapneumovirüs A/B | İnternal Kontrol | Adenovirüs |
| PCR Master Mix 3 | İnsan Parainfluenza Virusleri 1/2/3/4 | Rhinovirüs | Legionella pneumophila | Mycoplasma pneumoniae |
DNA/RNA izolasyonu, PCR inhibisyonu veya uygulama sorunlarını kontrol etmek için insan genomunda bulunan insan endojen nükleik asit dizisinin tespitine dayanan bir dahili kontrol kullanılmıştır. Kit ayrıca pozitif kontroller de içerir.
Bosphore SARS-CoV-2/Solunum Patojenleri Panel Kiti v3, insan solunum örneklerinden (nazofaringeal ve orofaringeal sürüntü ile tükürük dahil) aşağıdaki patojenlerin belirli gen bölgelerini tespit ve karakterize eden in vitro tanı amaçlı bir Real-Time PCR kitidir.
Floresan tespiti, FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| FAM | HEX | Texas RED | Cy5 | |
| PCR Master Mix 1 | SARS-CoV-2 | RSV A/B | Influenza A | Influenza B |
| PCR Master Mix 2 | Enterovirus | Human metapneumovirus A/B | İnternal Kontrol | Adenovirus |
| PCR Master Mix 3 | Human parainfluenza virus type 1/2/3/4 | Rhinovirus
|
Legionella pneumophila
|
Mycoplasma pneumoniae |
Nükleik asit izolasyonu, PCR inhibisyonu, örnekleme veya uygulama hatalarını kontrol etmek amacıyla, insan genomunda bulunan endojen bir nükleik asit dizisinin (RNase P) tespitine dayalı bir internal kontrol kullanılmıştır. Internal kontrolün amplifikasyon verileri, PCR Master Mix 2 için Texas RED filtresi ile tespit edilir.
Bosphore SARS-CoV-2/Solunum Patojenleri Panel Kiti v4, insan solunum örneklerinden (orofaringeal ve nazofaringeal sürüntü dahil) aşağıdaki patojenlerin gen bölgelerini tespit eden in vitro tanı amaçlı bir Real-Time PCR kitidir.
Floresan tespiti, FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| FAM | HEX
|
Texas RED
|
Cy5
|
|
| PCR Master Mix
1 |
Pandemic H1N1
|
Parechovirus
|
– | – |
| PCR Master Mix
2 |
Parainfluenza 1
|
Rhinovirus
|
Eksojen
İnternal Kontrol
|
Mycoplasma pneumoniae |
| PCR Master Mix
3 |
Enterovirus
|
Coronavirus NL63
|
Coronavirus 229E
|
Coronavirus HKU1
|
| PCR Master Mix
4 |
Parainfluenza 4 | Endogenous
Internal Control |
Parainfluenza 2
|
Parainfluenza 3
|
| PCR Master Mix
5 |
Coronavirus OC43
|
Human metapneumovirus A/B | Bocavirus
|
Adenovirus |
| PCR Master Mix
6 |
SARS-CoV-2
|
RSV A/B
|
Influenza A
|
Influenza B |
Nükleik asit izolasyonu, PCR inhibisyonu ve uygulama hatalarını kontrol etmek amacıyla kite eksojen bir internal kontrol entegre edilmiştir. Eksojen internal kontrolün amplifikasyon verileri, PCR Master Mix 2’de Texas RED filtresi ile tespit edilir. Internal kontrol, DNA/RNA izolasyonu sırasında veya PCR aşamasında eklenebilir.
Örnekleme, izolasyon ve uygulama hatalarını kontrol etmek için insan genomunda bulunan endojen bir nükleik asit dizisinin (RNase P geni) HEX filtresi ile tespitine dayalı endojen bir internal kontrol kullanılmıştır. Endojen internal kontrolün amplifikasyon verileri, PCR Master Mix 4’te HEX filtresi ile tespit edilir.
Bosphore SARS-CoV-2/Solunum Patojenleri Panel Kiti v5, insan solunum örneklerinden (orofaringeal ve nazofaringeal sürüntü dahil) aşağıdaki patojenlerin gen bölgelerini tespit eden in vitro tanı amaçlı bir Real-Time PCR kitidir.
Floresan tespiti, FAM, HEX, ROX ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| FAM
|
HEX
|
ROX
|
Cy5
|
|
| PCR Master Mix 1 | Adenovirus
|
RSV A/B
|
Influenza A
|
Influenza B
|
| PCR Master Mix 2 | Enterovirus
|
Human metapneumovirus A/B
|
Bocavirus
|
SARS-CoV-2
|
| PCR Master Mix 3 | Pandemic H1N1
|
Rhinovirus
|
Mycoplasma pneumoniae | Coronavirus OC43/HKU1
|
| PCR Master Mix 4 | Human parainfluenza virus type 1/2/3/4 | Parechovirus
|
Endogenous Internal Control | Coronavirus NL63/229E |
Örnekleme, izolasyon, PCR inhibisyonu ve uygulama hatalarını kontrol etmek için, insan genomunda bulunan endojen bir nükleik asit dizisinin (RNase P geni) ROX filtresi ile tespitine dayalı bir endojen internal kontrol kullanılmıştır. Endojen internal kontrolün amplifikasyon verileri, PCR Master Mix 4’te ROX filtresi ile tespit
Bosphore SARS-CoV-2/Grip/RSV Panel Kiti, insan solunum örneklerinden (nazofaringeal ve orofaringeal sürüntü, balgam ve tükürük dahil) 2019-nCoV (daha sonra Dünya Sağlık Örgütü tarafından resmi olarak Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) olarak adlandırılmıştır), RSV A&B ve Influenza A&B’yi tek tüpte tespit ve karakterize eden in vitro tanı amaçlı bir Real-Time PCR kitidir.
Floresan tespiti FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak yapılır. SARS-CoV-2 RNA’sı amplifiye edilir ve floresan tespiti FAM filtresi ile gerçekleştirilir; RSV A&B RNA’sı amplifiye edilir ve floresan tespiti HEX filtresi ile gerçekleştirilir; Influenza A&B RNA’sı amplifiye edilir ve floresan tespiti Cy5 filtresi ile gerçekleştirilir.
| FAM | HEX | Texas RED | Cy5 | |
| PCR Master Mix | SARS-CoV-2 | RSV A&B | İnternal Kontrol | Influenza A&B |
RNA izolasyonu, PCR inhibisyonu, örnekleme veya uygulama hatalarını kontrol etmek amacıyla, insan genomunda bulunan endojen bir nükleik asit dizisi (RNase P) tespitine dayalı bir internal kontrol kullanılmıştır. Internal kontrol, Texas RED filtresi ile tespit edilir.
Bosphore SARS-CoV-2/Grip/RSV Panel Kiti v2 nazofaringeal sürüntü, orofaringeal sürüntü, balgam ve tükürük gibi solunum yolu örneklerindeki yeni koronavirüsü (SARS-CoV-2), RSV A&B ve influenza A ve influenza B virüslerini tespit eder ve tanımlar.
FAM, HEX ve Cy5 filtreleri kullanılarak floresans okuma alınır. Yeni koronavirüs (SARS-CoV-2) genomunda bulunan 2 farklı bölge ile RSV tek reaksiyon ile tespit edilir. Genel tarama amacıyla E geni üzerindeki hedef bölge kullanılarak yeni koronavirüs ve genetik benzeri olan koronavirüsler (pan-Sarbecovirüs) tespit edilir, Orf1ab hedef bölgesi kullanılarak ise sadece yeni koronavirüs (SARS-CoV-2) spesifik olarak tanımlanır.
PCR Master Mix 1 ile yeni koronavirüs (SARS-CoV-2) hedef bölgesi çoğaltılarak FAM filtresi üzerinden, yeni koronavirüs ve genetik benzeri olan koronavirüslerin (pan-Sarbecovirüs) ise genel tarama bölgesi (E geni) çoğaltılarak Cy5 filtresi üzerinden florensans sinyal okumaları gerçekleştirilir.
Kit, nükleik asit izolasyonunu, PCR inhibisyonunu ve kullanıcı hatalarını kontrol etmek için kullanılan ve insan genomunda bulunan insan endojen nükleik asit dizisinin (RNase P) saptanmasına dayanan bir internal (iç) kontrol barındırmaktadır. İnternal kontrolün amplifikasyon verisi, Texas Red filtresi ile görüntülenir.
PCR Master Mix 2 ile RSV A&B, influenza A ve influenza B saptanır ve ayırt edilir.
| FAM | HEX | Texas Red | Cy5 | |
| Master Mix 1 |
Orf1ab (SARS-CoV-2) |
İnternal Kontrol (RNase P) |
N gene (SARS-CoV-2) |
E gene (SARS-CoV-2) |
| Master Mix 2 | Influenza A | RSV A&B | – | Influenza B |
İzolasyon kitlerindeki mevcut küresel sıkıntıyı çözmek ve olağan dışı koşullar altında çalışılmasını sağlamak için, ayrı bir izolasyon gerektirmeyen, sadece 20 dakikadan az süren bir ön işlemle alternatif, hızlı bir izolasyon geliştirdik. Bu yöntem, kurumların ve sağlık çalışanlarının teşhis için izolasyon ihtiyacını ortadan kaldırarak zamandan tasarruf etmelerine yardımcı olur. Direkt İzolasyon Çözümleri, Bosphore Yeni Koronavirüs (2019-nCoV) Saptama Kitleriyle birlikte kullanılacak şekilde optimize edilmiştir.
Bosphore SARS-CoV-2/Grip/RSV Panel Kiti v6, insan solunum örneklerinden (nazofaringeal ve orofaringeal sürüntü, balgam ve tükürük dahil) 2019-nCoV’yi (daha sonra Dünya Sağlık Örgütü tarafından resmi olarak Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) olarak adlandırılmıştır), RSV A&B ve Influenza A&B’yi tespit ve karakterize eden in vitro tanı amaçlı bir Real-Time PCR kitidir.
Floresan tespiti FAM, HEX, Texas RED, Cy5 ve Quasar 705 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| FAM | HEX | Texas RED | Cy5
|
Quasar 705 | |
| PCR Master Mix | SARS-CoV-2 | RSV A&B | İnternal Kontrol | Influenza B | Influenza A |
RNA izolasyonu, PCR inhibisyonu, örnekleme veya uygulama hatalarını kontrol etmek amacıyla, insan genomunda bulunan endojen bir nükleik asit dizisinin (RNase P) tespitine dayalı bir internal kontrol kullanılmıştır. Internal kontrol, Texas RED kanalı ile tespit edilir.
Bosphore Koronavirüs Panel Kiti v1, insan biyolojik örneklerinde Koronavirüs 229E, Koronavirüs HKU1, Koronavirüs OC43 ve Koronavirüs NL63’ü saptar ve karakterize eder. Floresan tespiti FAM, HEX, Texas Red ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
PCR Master Mix 1 tüpünde; Koronavirüs 229E genomu çoğaltılır ve Texas Red filtresi kullanılarak gerçekleştirilir. Koronavirüs HKU1 genomu çoğaltılır ve floresan tespiti, Cy5 filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
PCR Master Mix 2 tüpünde, Koronavirüs OC43 genomu çoğaltılır ve FAM filtresi kullanılarak floresans tespiti gerçekleştirilir. Koronavirüs NL63 genomu çoğaltılır ve floresan tespiti HEX filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
Kit, nükleik asit izolasyonu ve PCR inhibisyonunu kontrol etmek için bir internal kontrol barındırmaktadır. İnternal kontrol amplifikasyon verileri, PCR Master Mix 1’de HEX filtresi, PCR Master Mix 2’de Texas Red filtresiyle tespit edilir.
