Real-Time PCR Kitleri
Eklem Enfeksiyonu Patojenleri
Eklem enfeksiyonları, eklem boşluğunun bakteriyel veya fungal etkenlerle enfekte olması sonucu gelişir ve zamanında tanı konulmadığında fonksiyon kaybı ve kronik ağrı gibi ciddi komplikasyonlara yol açabilir. Protez eklemlerle ilişkili enfeksiyonlar da dahil olmak üzere bu tablolar, doğru tedavi kararlarını desteklemek için hızlı ve hassas tanı gerektiren karmaşık etiyolojilere sahiptir. Bosphore Eklem Enfeksiyonu Patojenleri Kitleri, insan eklem sıvısı örneklerinde yaygın bakteri ve mantar patojenlerinin Real-Time PCR tabanlı olarak eş zamanlı tespitini sağlar; seçili kitler ayrıca klinik açıdan önemli antibiyotik direnç genlerinin birlikte saptanmasına olanak tanıyarak klinik laboratuvarlara güvenilir ve kapsamlı tanı desteği sunar.
Başlıca Özellikler
İş Akışı
Teknik Özellikler
Bu tabloda belirtilen kanallar ve örnek tipleri kitlere (singleplex/multiplex) göre değişiklik gösterebilir. İlişkili kitlerin ayrıntılı bilgilerini aşağıda inceleyebilirsiniz.
| Termal Protokol | Tüm parametreler için tek termal protokol |
| Örnek Tipleri | İnsan sinoviyal sıvısı örnekleri ve uygun bir taşıma/işleme sistemi (ör. RILEVA Joint Biomaterials) kullanılarak protez materyalden elde edilen sıvılar |
| Raf Ömrü | 18 Ay |
| Kanallar | FAM, HEX, Texas Red, Cy5 |
| Nakliye / Depolama | (-90°C)-(-20°C) / -20°C |
Eklem Enfeksiyonu Patojenleri Panel Kitleri
Bosphore Eklem Enfeksiyonu Panel Kiti v1, insan sinoviyal sıvı örneklerinde ve uygun bir taşıma/işleme sistemi (ör. RILEVA Joint Biomaterials) kullanılarak prostetik materyalden elde edilen sıvıda eklem patojenlerini tespit ve karakterize etmek için tasarlanmış bir Real-Time PCR kitidir. Floresans tespiti FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| İçerik | FAM
(Gen) |
HEX
(Gen) |
Texas RED
(Gen) |
Cy5
(Gen) |
| PCR Master Mix 1 | S. agalactiae
(cfB) |
S. haemoliticus
(mvaA) |
S. pneumoniae
(lytA) |
E. faecalis
(DDL) |
| PCR Master Mix 2 | K. pneumoniae
(Hemolysin) |
P. anaerobius
(16S rRNA) |
S. marcescens
(16S rRNA/ ITS/23S rRNA) |
E. faecium
(DDL) |
| PCR Master Mix 3 | C. perfringens (16S rRNA) | Peptoniphilus spp.
(16S rRNA) |
S. pyogenes
(speB) |
Citrobacter spp.
(phage resistance protein/lacZ) |
| PCR Master Mix 4 | C. albicans
(ITS2) |
M. morganii
(23S rRNA) |
E. cloacae
(rpoB) |
P. aeruginosa
(16S rRNA) |
| PCR Master Mix 5 | N. gonorrhoeae
(Porin) |
P. micra
(rpoB) |
E. coli
(uidA) |
S. capitis
(sodA) |
| PCR Master Mix 6 | H. influenzae
(OMP P6) |
Proteus spp.
(atpD) |
K. aerogenes (E. aerogenes)
(gyrB) |
Salmonella spp.
(ttrb) |
| PCR Master Mix 7 | B. fragilis
(16S rRNA) |
C. avidum
(23S rRNA) |
S. lugdunensis
(fbl) |
A. prevotii/vaginalis
(16S rRNA) |
| PCR Master Mix 8 | K. kingae
(mdh) |
C. striatum
(FTR1) |
F. magna
(16S rRNA) |
Internal Control |
| PCR Master Mix 9 | P. acnes
(cfb) |
S. epidermidis
(sodA) |
Candida spp.
(ITS2) |
S. warneri
(nuc) |
| PCR Master Mix 10 | NDM | OXA-48 | Van A | KPC |
| PCR Master Mix 11 | IMP | VIM | CTX-M | Van B |
| PCR Master Mix 12 | mecA – mecC genes (SCCmec types 1-15) | S. aureus
(Nuc) |
Internal Control (RNase P) | SCCmec
(Orfx junction MREJ genotypes- i, ii, iii, iv, v, vii, xii, xxi) |
DNA izolasyonunu, PCR inhibisyonunu veya uygulama problemlerini kontrol etmek amacıyla kite ekzojen internal kontrol entegre edilmiştir. Ekzojen internal kontrolün amplifikasyon verileri, PCR Master Mix 8’in Cy5 filtresi ile tespit edilir. Internal kontrol, DNA izolasyonu veya PCR aşaması sırasında eklenebilir.
DNA izolasyonunu, PCR inhibisyonunu, örnekleme veya uygulama hatalarını kontrol etmek amacıyla, insan genomunda bulunan insan endojen nükleik asit dizisinin (RNase P geni) Texas RED filtresi ile tespitine dayalı bir endojen internal kontrol kullanılmıştır. Endojen internal kontrolün amplifikasyon verileri, PCR Master Mix 12’de Texas RED filtresi ile tespit edilir.
Bosphore Eklem Enfeksiyonu Panel Kiti v2, insan sinovial sıvı örneklerinden Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Enterococcus faecalis, Klebsiella pneumoniae, Peptostreptococcus anaerobius, Serratia marcescens, Enterococcus faecium, Clostridium perfringens, Peptoniphilus spp., Streptococcus pyogenes, Citrobacter spp., Candida spp., Candida albicans, Morganella morganii, Enterobacter cloacae complex, Pseudomonas aeruginosa, Neisseria gonorrhoeae, Parvimonas micra, Escherichia coli, Streptococcus spp., Haemophilus influenzae, Proteus spp., Klebsiella aerogenes (E. aerogenes), Salmonella spp., Bacteroides fragilis, Cutibacterium avidum, Staphylococcus lugdunensis, Anaerococcus prevotii/vaginalis Kingella kingae, Cutibacterium granulosum ve Finegoldia magna patojenlerini saptayan ve ayırt eden, vücut dışı tanıya yönelik bir Real-Time PCR kitidir. Floresans saptama FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| Bileşen | FAM (Gen) | HEX (Gen) | Texas RED (Gen) | Cy5 (Gen) |
| PCR Master Mix 1 | S. agalactiae (cfB) |
S. aureus (nucA) |
S. pneumoniae (lytA) |
E. faecalis (DDL) |
| PCR Master Mix 2 | K. pneumoniae (Hemolysin) |
P. anaerobius (16S rRNA) |
S. marcescens (16S rRNA/ITS/23S rRNA) |
E. faecium (DDL) |
| PCR Master Mix 3 | C. perfringens (16S rRNA) |
Peptoniphilus spp. (16S rRNA) |
S. pyogenes (speB) |
Citrobacter spp. (phage resistance protein/lacZ) |
| PCR Master Mix 4 | C. albicans (ITS2 bölgesi) |
M. morganii (23S rRNA) |
E. cloacae complex (rpoB) |
P. aeruginosa (16S rRNA) |
| PCR Master Mix 5 | N. gonorrhoeae (Porin) |
P. micra (rpoB) |
E. coli (uidA) |
Streptococcus spp. (16S rRNA/ITS/23S rRNA) |
| PCR Master Mix 6 | H. influenzae (OMP P6) |
Proteus spp. (atpD) |
K. aerogenes (E. aerogenes) (gyrB) |
Salmonella spp. (ttrb) |
| PCR Master Mix 7 | B. fragilis (16S rRNA) |
C. avidum (23S rRNA) |
S. lugdunensis (fbl) |
A. prevotii/vaginalis (16S rRNA) |
| PCR Master Mix 8 | K. kingae (mdh) |
C. granulosum (16S rRNA) |
F. magna (16S rRNA) |
İnternal Kontrol |
| PCR Master Mix 9 | – | – | Candida spp (ITS2 bölgesi) |
– |
Kit, DNA izolasyonu, PCR inhibisyonu ve uygulama hatalarını kontrol etmek için İnternal Kontrol (IC) barındırmaktadır. İnternal Kontrol, DNA izolasyonu sırasında ya da PCR reaksiyon karışımına eklenebilir. İnternal Kontrol için floresans saptama PCR Master Mix 8’ in Cy5 filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
Bosphore Eklem Enfeksiyonu Panel Kiti v3, insan sinoviyal sıvı örneklerinde ve uygun bir taşıma/işleme sistemi (ör. RILEVA Joint Biomaterials) kullanılarak protez materyalden elde edilen sıvıda eklem enfeksiyonu patojenlerini tespit ve karakterize etmek için tasarlanmış bir Real-Time PCR kitidir.
Floresans tespiti FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| Component | FAM
(Gen) |
HEX
(Gen) |
Texas RED
(Gen) |
Cy5
(Gen) |
| PCR Master Mix 1 | S. agalactiae
(cfB) |
– | S. pneumoniae
(lytA) |
E. faecalis
(DDL) |
| PCR Master Mix 2 | K. pneumoniae
(Hemolysin) |
P. anaerobius
(16S rRNA) |
S. marcescens
(16S rRNA/ ITS/23S rRNA) |
E. faecium
(DDL) |
| PCR Master Mix 3 | C. perfringens (16S rRNA) | Peptoniphilus spp.
(16S rRNA) |
S. pyogenes
(speB) |
Citrobacter spp.
(phage resistance protein/lacZ) |
| PCR Master Mix 4 | C. albicans
(ITS2) |
M. morganii
(23S rRNA) |
E. cloacae
(rpoB) |
P. aeruginosa
(16S rRNA) |
| PCR Master Mix 5 | N. gonorrhoeae
(Porin) |
P. micra
(rpoB) |
E. coli
(uidA) |
Streptococcus spp.
(16S rRNA/ ITS/23S rRNA) |
| PCR Master Mix 6 | H. influenzae
(OMP P6) |
Proteus spp.
(atpD) |
K. aerogenes (E. aerogenes)
(gyrB) |
Salmonella spp.
(ttrb) |
DNA izolasyonunu, PCR inhibisyonunu veya uygulama problemlerini kontrol etmek amacıyla kite ekzojen internal kontrol entegre edilmiştir. Ekzojen internal kontrolün amplifikasyon verileri, PCR Master Mix 8’in Cy5 filtresi ile tespit edilir. Internal kontrol, DNA izolasyonu veya PCR aşaması sırasında eklenebilir.
DNA izolasyonunu, PCR inhibisyonunu, örnekleme veya uygulama hatalarını kontrol etmek amacıyla, insan genomunda bulunan insan endojen nükleik asit dizisinin (RNase P geni) Texas RED filtresi ile tespitine dayalı bir endojen internal kontrol kullanılmıştır. Endojen internal kontrolün amplifikasyon verileri, PCR Master Mix 12’de Texas RED filtresi ile tespit edilir.
