Real-Time PCR Kitleri
Mantarlar
Mantarlar, ekosistemlerde hayati bir rol oynayan ancak özellikle bağışıklığı baskılanmış bireylerde bir dizi enfeksiyona neden olabilen çeşitli mikroorganizma gruplarıdır.
Candida cinsi, hastane kaynaklı enfeksiyonlardan sorumlu en yaygın mantar organizma gruplarından biridir. 20’den fazla türü kapsar. Candida kaynaklı enfeksiyonlar topluca kandidiyazis olarak adlandırılır ve orofaringeal kandidiyazis, vajinal kandidiyazis ve invaziv kandidiyazis olarak kategorize edilebilir. İnvaziv kandidiyazis, Candida türlerinin kan dolaşımına girmesiyle ortaya çıkar ve ciddi sistemik enfeksiyonlara yol açar.
Havayla taşınan bir mantar cinsi olan Aspergillus, ekosistemin doğal bir bileşenidir. Bu cins 100’den fazla türü içerir, ancak bunlardan yalnızca birkaçı patojendir. Bu patojen türler, eşeysiz sporlarının solunmasıyla aşırı duyarlılık reaksiyonlarına, enfeksiyon hastalıklarına ve toksik etkilere neden olabilir. Aspergillus enfeksiyonları topluca aspergilloz olarak adlandırılır ve alerjik bronkopulmoner aspergilloz (ABPA), kronik pulmoner aspergilloz, invaziv aspergilloz ve cilt aspergillozu gibi durumları içerir. Bağışıklığı baskılanmış veya bağışıklık yetmezliği olan bireylerde, kanser hastalarında ve akciğer hastalığı olan kişilerde Aspergillus enfeksiyonları hayatı tehdit edici olabilir.
Başlıca Özellikler
Teknik Özellikler
Bu tabloda belirtilen kanallar ve örnek tipleri kitlere (singleplex/multiplex) göre değişiklik gösterebilir. İlişkili kitlerin ayrıntılı bilgilerini aşağıda inceleyebilirsiniz.
| Örnek Tipleri | Kan, kan kültürü, epitel hücreleri, semen, idrar, prostat salgıları gibi insan biyolojik örnekleri |
| Raf Ömrü | 18 Ay |
| Kanallar | FAM, HEX, Cy5 |
| Nakliye / Depolama | (-90°C)-(-20°C) / -20°C |
Mantar Kitleri
Bosphore Aspergillus Saptama Kiti v1, insan biyolojik örneklerindeki; Aspergillus fumigatus, Aspergillus ustus, Aspergillus flavus , Aspergillus versicolor, Aspergillus glaucus, Aspergillus niger, Aspergillus terreus, Aspergillus sclerotiorum, Aspergillus ochraceus, Aspergillus candidus, Aspergillus alliaceus, Aspergillus wentii, Aspergillus carbonarius, Aspergillus sydowii, Aspergillus oryzae, Aspergillus ficuum , Aspergillus silvaticus , Aspergillus nidulans, Aspergillus tamarii, Aspergillus proliferans, Aspergillus cervinus, Aspergillus restrictus, Aspergillus pseudoglaucus, Aspergillus sparsus, Aspergillus flavipes; Aspergilus türlerini saptar. Kitin analitik duyarlılığı 10 kopya/µl’dir. Aspergillus genomunun 18S ribozomal RNA geninin bir bölümü çoğaltılır ve floresans saptama FAM filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
Kit, nükleik asit izolasyonu ve PCR inhibisyonunu kontrol etmek için bir internal kontrol içermektedir. İnternal kontrolün amplifikasyon verisi, HEX filtresi ile görüntülenir.
Bosphore Candida albicans Saptama Kiti v1, 98/79/EC Talimatı uyarınca IVD-CE onaylı Real-Time PCR temeline dayanan tıbbi bir vücut-dışı tanı kitidir. Bosphore Candida albicans Saptama Kiti v1 kan, kan kültürü, epitel hücreleri, semen, idrar, prostat salgıları gibi insan biyolojik örneklerindeki C. albicans DNA’sını saptar. Kitin analitik duyarlılığı, 100 kopya/ml’dir. Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2) geninin bir bölümü çoğaltılır ve floresans saptama FAM filtresi ile gerçekleştirilir.
Kit, nükleik asit izolasyonu ve PCR inhibisyonunu kontrol etmek için bir internal kontrol barındırmaktadır. İzolasyon ya da PCR aşamasında eklenebilen internal kontrolün amplifikasyon verisi HEX filtresi ile görüntülenir.
Bosphore C. auris Saptama Kiti v1, tam kan, serum, plazma, burun sürüntüsü, koltuk altı ve kasık sürüntüsü örneklerinden Candida auris‘in ITS1/5.8S rRNA ve ITS2/LSU rRNA genlerini saptayan ve ayırt eden, vücut dışı tanıya yönelik bir Real-Time PCR kitidir. Floresans saptama Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir. C. auris DNA’sı amplifiye edilir ve Texas RED filtresi kullanılarak floresans tespiti gerçekleştirilir.
| Bileşen | Texas RED (Gen) | Cy5 |
| PCR Master Mix | Candida auris (ITS1/5.8S rRNA ve ITS2/LSU rRNA genleri) | İnternal Kontrol |
Kit, DNA izolasyonu, PCR inhibisyonu ve uygulama hatalarını kontrol etmek için internal kontrol (IC) barındırmaktadır. İnternal kontrol, DNA izolasyonu sırasında ya da PCR reaksiyon karışımına eklenebilir. İnternal kontrol için floresans saptama Cy5 filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
Bu kit versiyonu, kapalı ve kontaminasyon kontrollü bir ortamda otomatik manyetik boncuk bazlı nükleik asit izolasyonu, PCR kurulumu, amplifikasyon ve floresans tespiti gerçekleştiren UNIO 448 Sistemi ile tamamen uyumludur. UNIO 448 yazılımı, barkodlu reaktifleri otomatik olarak tanır ve Bosphore C. auris Detection Kit v1 için onaylanmış test protokolünü uygular.
Mantar Panel Kitleri
Bosphore Candida Temel Panel Kiti v2, 98/79/EC Talimatı uyarınca IVD-CE onaylı Real-Time PCR temeline dayanan tıbbi bir vücut-dışı tanı kitidir. Bosphore Candida Temel Panel Kiti v2, insan biyolojik örneklerinde Candida albicans, Candida glabrata, Candida krusei ve Candida parapsilosis saptar ve karakterize eder. Floresans tespiti FAM, HEX, Texas Red ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
PCR Master Mix 1 tüpünde, Candida albicans genomu çoğaltılır ve FAM filtresi kullanılarak floresans tespiti gerçekleştirilir. Candida glabrata genomu çoğaltılır ve floresans tespiti, Cy5 filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
PCR Master Mix 2 tüpünde, Candida krusei genomu çoğaltılır ve HEX filtresi kullanılarak floresans tespiti gerçekleştirilir. Candida parapsilosis genomu çoğaltılır ve floresans tespiti Cy5 filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
Kit, nükleik asit izolasyonu ve PCR inhibisyonunu kontrol etmek için bir internal kontrol barındırmaktadır. İnternal kontrol amplifikasyon verileri, PCR Master Mix 1 ve PCR Master Mix 2’deki Texas Red filtresiyle tespit edilir.
Bosphore Fungal Solunum Yolu Saptama Kiti v1, BAL, balgam, trakeal aspirat, doku/biyopsi, boğaz sürüntüsü, nazofarengeal sürüntü gibi insan solunum örneklerinden Aspergillus spp., Mucor spp. ve Pneumocystis jirovecii‘nin neden olduğu Pneumocystis pneumonia (PCP)’yi saptayan ve ayırt eden, vücut dışı tanıya yönelik bir Real-Time PCR kitidir. Floresans saptama FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
PCR Master Mix’te, Aspergillus spp. DNA’sı amplifiye edilir ve FAM filtresi kullanılarak floresans tespiti gerçekleştirilir, Mucor spp. DNA’sı amplifiye edilir ve HEX filtresi kullanılarak floresans tespiti gerçekleştirilir ve Pneumocystis jirovecii DNA’sı amplifiye edilir ve Texas RED filtresi kullanılarak floresans tespiti gerçekleştirilir.
| Bileşen | FAM
(Gen) |
HEX
(Gen) |
Texas RED
(Gen) |
Cy5
(Gen) |
| PCR Master Mix | Aspergillus spp.
(18S rRNA) |
Mucor spp.
(rDNA operon) |
Pneumocystis jirovecii (PCP)
(mt-LSU RNA) |
Endojen İnternal Kontrol
(RNase P) |
Kit, DNA izolasyonu, PCR inhibisyonu ve uygulama hatalarını kontrol etmek için İnsan genomunda bulunan insan endojen nükleik asit dizisinin (RNase P geni) saptanmasına dayalı bir internal kontrol (IC) barındırmaktadır. İnternal kontrol için floresans saptama PCR Master Mix’deki Cy5 filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
Bosphore Candida Tarama & Tiplendirme Kiti v1, insan tam kan, serum ve plazma örneklerinden Candida spp., Candida albicans, Candida tropicalis, Candida glabrata ve Candida parapsilosis‘i tespit ve karakterize eden, in vitro tanıya yönelik bir Real-Time PCR kitidir. Floresans tespiti FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| Component | FAM
(Gene) |
HEX
(Gene) |
Texas RED
(Gene) |
Cy5
(Gene) |
| PCR Master Mix 1 | – | Internal Control | Candida spp. (ITS region) | – |
| PCR Master Mix 2 | Candida albicans
(ITS region) |
Candida tropicalis
(ITS region) |
Candida glabrata
(ITS region) |
Candida parapsilosis
(ITS region) |
DNA izolasyonunu, PCR inhibisyonunu veya uygulama sorunlarını kontrol etmek amacıyla kite internal kontrol entegre edilmiştir. Internal kontrolün amplifikasyon verisi, PCR Master Mix 1’in HEX filtresi ile tespit edilir. Internal kontrol, DNA izolasyonu veya PCR aşamasında eklenebilir.
Bosphore Candida Tarama & Tiplendirme Kiti v2, insan tam kan örneklerinden Candida spp., Candida albicans, Candida tropicalis, Candida glabrata, Candida parapsilosis, Candida dubliniensis, Candida auris ve Candida krusei patojenlerini saptayan ve ayırt eden, vücut dışı tanıya yönelik bir Real-Time PCR kitidir. Floresans saptama FAM, HEX, Texas RED ve Cy5 filtreleri kullanılarak gerçekleştirilir.
| Bileşen | FAM
(Gen) |
HEX
(Gen) |
Texas RED
(Gen) |
Cy5
(Gen) |
| PCR Master Mix 1 | – | İnternal Kontrol | Candida spp. (ITS bölgesi) | – |
| PCR Master Mix 2 | Candida albicans
(ITS bölgesi) |
Candida tropicalis
(ITS bölgesi) |
Candida glabrata
(ITS bölgesi) |
Candida parapsilosis (ITS bölgesi) |
| PCR Master Mix 3 | Candida
dubliniensis (ITS region) |
Candida auris
(ITS region) |
Candida krusei
(ITS region) |
– |
Kit, DNA izolasyonu, PCR inhibisyonu ve uygulama hatalarını kontrol etmek için internal kontrol (IC) barındırmaktadır. İnternal kontrol, DNA izolasyonu sırasında ya da PCR reaksiyon karışımına eklenebilir. İnternal kontrol için floresans saptama PCR Master Mix 1’de HEX filtresi kullanılarak gerçekleştirilir.
